首个国审棉花抗黄萎病品种中植棉2号基因组被破译

        中国农科院植保所经济作物真菌病害监测与防控创新团队在《Molecular Plant-Microbe Interactions》上发布了我国第一个国审棉花抗黄萎病品种—中植棉2号的染色体级别基因组，为解析陆地棉抗黄萎病的基因组与遗传变异奠定了基础。本研究利用PacBio Sequel和Illumina对中植棉2号进行了基因组测序与组装，并通过Hi-C技术将组装结果挂载到了26条染色体上，最终获得了2.33 Gb大小的染色体级别基因组。结合从头预测、同源预测、RNA-seq技术等方法对基因组进行了注释，获得了95327个蛋白编码基因。在此基础上，进行了中植棉2号、陆地棉TM-1（耐黄萎病种质）和海岛棉3-79（抗黄萎病种质）基因组比较分析，发现中植棉2号基因组较同样是陆地棉的TM-1编码更多参与转录调控的特异基因，这可能是中植棉2号抗性成因的关键遗传基础。该基因组发布将为后续陆地棉黄萎病抗性成因的基因组学基础解析、抗黄萎病遗传位点鉴定和分子设计育种提供了重要的科学支撑。