中国农业科学院茶叶研究所发布茶树基因组变异数据库

        为实现茶树种质资源基因型的数字化鉴定与管理，中国农业科学院茶叶研究所联合丽水市农林科学研究院、韩国国立园艺与草本研究院、阿塔图尔克大学等单位，开发完成茶树基因组变异数据库TeaGVD。相关成果发表在《Frontiers in Plant Science》上。该数据库整合鉴定超过7,000多万的基因组变异位点、1,229份茶树资源的基因型数据、464种代谢物的表型数据和17,974个基因型-表型关联位点。该数据库主要用于茶树种质资源基因组变异（SNP和InDel）的数字化管理与大数据在线分析，能够根据基因组位置、基因信息、材料比较、基因或变异编号等不同的策略检索基因组SNP和InDel。通过本平台还能够实现茶树种质资源的代谢表型查询及GWAS分析，快速挖掘性状相关的SNP和InDel位点。此外，本平台还整合了在线Blast、序列提取、引物设计、群体遗传分析等工具。