西南大学陈新平团队联合德国波恩大学等国内外多所高校在《自然-植物》(Nature Plants)期刊发表了题为“遗传性微生物组的变异与当地适应玉米品种的来源环境相关”(Heritable microbiome variation is correlated with source environment in locally adapted maize varieties)的论文,揭示了非生物胁迫下植物-微生物有益互作的遗传基础和环境调控机制。该研究应用玉米地方种质资源群体探索作物与微生物互作关系,从作物与自然环境适应性角度去理解作物在抵抗非生物胁迫方面的微生物潜能。课题组综合利用微生物扩增子测序技术-作物群体遗传学方法-基因组预测手段,揭示玉米种子原生栖息地生态环境信息可以很好地预测未来新的环境下的根系和根际微生物的组装;引入植物环境基因组学关联分析(eGWAS)找到特定的玉米遗传位点显著与材料来源当地的氮素水平及根际益生菌(Massilia)关联;通过玉米转座子突变体库找到不同遗传背景条件下 (B73 和F7) 的玉米单个基因调控根际微生物群落及特定的根际益生菌;通过接菌功能验证发现根际益生菌的促生功能独立于土壤条件,具有重大的农业应用潜能。研究成果不仅为适应生态条件的作物遗传改良提供了创新思路,而且为养分高效品种培育提供了靶向基因和根际微生物。