广东省科学院南繁种业研究所在玉米单细胞转录组测序取得新进展

        为阐明不同细胞类型的基因表达特征，南繁种业所生物育种研究室于《The Crop Journal》在线发表了题为“Single-cell RNA sequencing reveals the landscape of maize root tips and assists in identification of cell type-specific nitrate-response genes”的研究论文，通过测定超过7000个玉米根尖细胞的单细胞转录组，共确定了11种细胞类型/组织和85个细胞类型特异的硝态氮响应基因（包含多个已知的硝态氮代谢基因）。伪时间序列和轨迹分析在单细胞水平上证实根毛细胞由表皮分化而来。结合已发表的三个水稻根尖单细胞转录组，发现根毛、内皮层和韧皮部三种细胞类型的基因表达在两个物种间较为保守，并且分别鉴定到多个保守的直系同源基因。这些研究结果将对基因克隆、功能研究、甚至基因表达精细调控具有指导意义。